Changements relatifs à la mesure de la virémie par PCR pour les infections virales suivantes: HIV, HCV et HBV pour le laboratoire de diagnostic du Service d'immunologie et d'allergie

Début: le 14 novembre 2005

A nos demandeurs

Madame, Monsieur, cher(e) Collègue,

Nous vous informons par la présente d’un changement méthodologique important concernant les analyses par PCR réalisées dans notre laboratoire. En effet, nous allons introduire le système de PCR en temps réel de Roche (Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan) pour la détermination dans le plasma de l’ARN de HIV et de HCV et celle de l’ADN de HBV.

Grâce à ce système, l’isolation des acides nucléiques du plasma sera entièrement automatisée et la détection ou la quantification de ces acides nucléiques se fera au cours de la PCR même, et non lors d’une étape ultérieure. L’analyse sera facilitée, les risques de contamination croisée moindres et les plages de mesure beaucoup plus étendues, ce qui permettra d’éviter bon nombre de réanalyses après dilution. Voici quelques détails techniques :

HIV

• il n’y aura plus qu’une seule méthode: plus de distinction entre «méthode standard» et «méthode ultrasensible»
• seuil de détection: 40 copies/ml
• intervalle de quantification: de 40 à 1 x 10⁷ copies/ml
• aucun changement d’unités, mais les résultats avec la nouvelle méthode seront en moyenne 1,9 x (0,29 log₁₀) plus bas qu’avec l’ancienne méthode

HCV

• il n’y aura plus qu’une seule méthode: plus de distinction entre «méthode qualitative» et «méthode quantitative»
• seuil de détection: 15 UI/ml (0,015 kUI/ml)
• intervalle de quantification: de 43 à 6,9 x 10⁷ UI/ml (soit de 0,043 à 69'000 kUI/ml)
• les résultats seront exprimés en UI/ml et non plus en kUI/ml. Il faudra donc diviser par 1'000 (10³) les nouveaux résultats pour les comparer aux anciens
• les résultats avec la nouvelle méthode seront en moyenne 2 x (0,30 log₁₀) plus bas qu’avec l’ancienne méthode

HBV

• seuil de détection: 12 UI/ml
• intervalle de quantification: de 55 à 1,1 x 10⁸ UI/ml
• aucun changement d’unités: depuis le 8 juin 2005, nos résultats sont exprimés en UI/ml (rappel : il faut diviser le résultat en UI/ml par 190 pour obtenir des kcopies/ml)
• les résultats obtenus avec la nouvelle méthode seront identiques à ceux obtenus avec l’ancienne méthode

Considérations pratiques

• un nouveau bon d’analyse a été édité pour tenir compte de ces changements.
  En effet, le progrès a ses revers: le volume de sang nécessaire avec la nouvelle technique est plus important (2 x 5,5 ml pour une PCR virale, plus 1 x 5,5 ml par PCR supplémentaire)
• seul du sang surEDTA (ou du plasma-EDTA préparé dans un laboratoire selon les bonnes pratiques exigées par la PCR) sera accepté

Nous sommes bien entendu à votre entière disposition pour tout renseignement complémentaire. Pour les questions pratiques, veuillez contacter le laboratoire au 021-314 08 05. Pour des questions théoriques, veuillez vous adresser au Dr Philippe Bürgisser au 021-314 07 88 (du lundi au jeudi dès 12h15).

Veuillez recevoir, Madame, Monsieur, cher(e) Collègue, nos salutations les meilleures.

Novembre 05